همسانه¬سازی مولکولی، جداسازی و توصیف یک ژن پکتات لیاز از بافت حبه انگور بی¬دانه سفید (vitis vinifera l. cv. bidaneh sefid)

یکی از فعالیت­های مهم سلول­های گیاهی در دوره رشد آن، فعال نمودن ژن­های عامل و آنزیم­های موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. بر اساس مطالعات انجام شده، آنزیم­های مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهم­ترین این آنزیم­ها، آنزیم پکتات لیاز می­باشد. در این مطالعه، cdna ناقص یکی از ژن­های پکتات لیاز از بافت حبه انگور بی­دانه سفید (vitis vinifera l. cv. bidaneh sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره­ای پلی­مراز نسخه­برداری معکوس (reverse transcriptase-pcr) جداسازی و در ناقل puc19 همسانه­سازی و ساختار مولکولی، ویژگی­های بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن، تحت عنوان vvpel1، به­طول  bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز می­کند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیش­بینی شده این پروتئین به­ترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 می­باشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی vvpel1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالی­های پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر می­باشد. توالی پروتئینی به­دست آمده شباهت زیادی را با توالی­های پکتات لیاز سایر گیاهان از قبیل ricinus communis، fragaria ananassa، prunus persica و populus trichocarpa نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه i پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.